Análisis de la diversidad procariótica en ambientes acuáticos mediante la utilización de técnicas moleculares y aislamiento microorganismos en cultivo puro

Resumen

Para el estudio de la diversidad procariótica en los ambientes estudiados en esta tesis (medio marino y salinas solares) se han utilizado tanto las técnicas clásicas de aislamiento en cultivo puro como las técnicas moleculares de identificación de microorganismos, intentando en lo posible evitar el sesgo que produce la utilización de un solo tipo de técnica. En la mayor parte de los trabajos presentados se ha realizado en primer lugar una evaluación global de la biodiversidad procariótica existente en el ambiente o "fingerprinting", aplicando una metodología molecular sencilla que se conoce como RISA (Ribosomal Internal Analysis), de gran utilidad para comparar múltiples muestras de forma simultánea y observar posibles variaciones bajo diferentes condiciones ambientales. Posteriormente, de las muestras más interesantes obtenidas con esta primera aproximación, se ha determinado mediante clonaje y secuenciación de los genes rRNA 16S cuáles son los grupos filogenéticos presentes en la muestra natural y en los cultivos llevados a cabo. Por último, se han estudiado con más detalles aquellos grupos de secuencias o aislados que, por su baja similaridad con filotipos o microorganismos ya descritos, parecían ser interesantes desde el punto de vista de la biodiversidad. Ambientes marinos El primero de los trabajos realizados, llevado a cabo con muestras procedentes del Océano Antártico obtenidas durante la Campaña DHARMA, ha contribuido de forma significativa al conocimiento de las comunidades procarióticas del océano profundo. En este estudio, mediante la clonación y secuenciación de los rRNA 16S, investigamos la diversidad procariótica en muestras obtenidas a 3000 metros de profundidad en el Frente Polar Antártico. Durante el análisis de las secuencias obtenidas a partir de esta muestra, se detectó la existencia de un nuevo filotipo formado por un grupo de secuencias relacionado con las Euryarchaeotas, cuya posi